車検のマナーとして、車検を受ける際は予め車内にあるクッションや小物類を片づけておいた方が良いと思いがちです。
実際のところ問題となるかどうかはケースバイケースですが、車の構造に影響を与えるものでなければ、そのままでも大丈夫だと考えることができます。
ぬいぐるみなども基本的には車内に置いたまま車検を受けられますが、車内に固定するのはやめた方が良いです。
固定してしまうと、車に手を加えたとみなされてもおかしくないので、ぬいぐるみを含めてクッションや小物類も両面テープで貼りつけたり、接着剤などで固定するのは避けるべきです。
また、車内点検の妨げになるほど大量に置くのもNGなので、ぬいぐるみを置くにしても常識的な範囲内に留めるのが無難です。